Конохагакуре (木ノ葉隠れの里, "Konohagakure no Sato", "Деревня скрытая в листве") она же Коноха — деревня, в которой живут главные герои Наруто. Она была построена первым Хокаге Сенджу Хаширамой и Учихой Мадарой в стране огня. После конфликта и последовательной схватки в долине свершения, Мадара покинул Коноху и жил в изгнании. Младший брат первого Хокаге, Сенджу Тобирама, дальше отстраивал Конохи и назначил Сарутоби Хирузена третьим Хокаге, который в свою очередь выбрал четвертого Хокаге.
Во время его правления на деревню напал девятихвостый лис Кьюби. Жертвуя своей жизнью, четвертый Хокаге запечатал Биджу в Узумаки Наруто. После смерти четвертого, Сарутоби снова стал Хокаге, до тех пор пока на Коноху не напал Орочимару. В этой короткой войне, в которой участвовала деревня Сунагакуре, погиб Сарутоби, после того как запечатал руки Орочимару. По этому начались поиски пятого Хокаге. Тсунаде согласилась и стала первым Хокаге женского пола.
Разрушенная Коноха
Пэйн и Конан отправились в поиски последнего Биджу. Их поиски привели их прямо в Коноху. Прибыв к вратам Конохи, он замечает, что вся деревня окружена барьером. Однако Пэйну удается пройти через этот защитный барьер. В Конохе он уничтожает много зданий. Узнав, что Наруто не в деревне, он использует Шинра Тенсей и уничтожает большую часть Конохи. Уничтожение достигает портретов Хокаге и стены, которой окружена деревня.
Позже Нагато оживляет всех умерших жителей с помощью Гедо Ринне Тенсей но Дзюцу, а Ямато создает новые дома, используя Мокутон: Ренчука но Дзюцу. После поражения Пэйна шестым Хокаге становится Данзо с согласием Даймё страны огня. В бою против Учихи Саске Данзо погибает и Тсунаде, которая очнулась, возвращается на пост Хокаге. 
Кланы:
Клан Учиха
Клан Хьюга
Клан Нара
Клан Акимичи
Клан Яманака
Клан Абураме
Клан Инузука
Клан Сарутоби
Клан Хатаке
Клан Курама